Estudio del gen Apetala2 como marcador molecular para identificación de especies de la familia Orchidaceae en los géneros Gongora, Restrepia, Epidemdrum
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http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/25310
Title: | Estudio del gen Apetala2 como marcador molecular para identificación de especies de la familia Orchidaceae en los géneros Gongora, Restrepia, Epidemdrum |
Authors: | Solis Aguirre, Henry David |
Advisor: | Cerna Cevallos, Marco Fernando |
Abstract: | Orchidaceae family comprises a large family of plants whose distinctive feature is its particular flowers shapes where Apetala 2 gene is known as a straight regulator. Being orchids species threatened, molecular techniques represent tools of great impact in the field of biodiversity conservation as rapid identification at species level is possible and can be done. The aim of the present study consists in demonstrating the Apetala 2 utility as molecular marker in order to identify types of orchids focusing on Ecuadorian endemic species: Gongora, Restrepia and Epidendrum. To accomplish this objective primer design was conducted from Ap2 complete sequence of Arabidopsis Thaliana to perform PCR and sequencing assays. Results verified the functionality of in silico PCR primers design owing to amplification of roughly 2000bp-sized band with the first set of primers, as well as 500bp-sized band with the second set of primers, both of them in Epidendrum nocturnum species. PCR products were not observed in Gongora and Restrepia genus, likewise other Epidendrum species. In conclusion Apetala 2 could be considered as molecular marker where primer design is critical to accurately guarantee correct identification. |
Translated abstract: | La familia Orchidaceae comprende una extensa familia de plantas cuyo sello distintivo es la forma particular de sus flores en donde el gen Apetala 2 (AP2) es un regulador directo de esta característica. Siendo las orquídeas especímenes que se encuentran bajo amenaza, las técnicas moleculares representan herramientas de gran impacto para la conservación de la biodiversidad al permitir la identificación rápida y certera a nivel de especie de cualquier ejemplar. Es así como el presente estudio tiene como objetivo plasmar la utilidad del gen AP2 como un marcador molecular para la identificación de orquídeas con enfoque en especies endémicas del Ecuador como son: Gongora, Restrepia y Epidendrum. Para ello se llevó a cabo el diseño de los cebadores correspondientes a partir de la secuencia completa de AP2 de la planta modelo Arabidopsis thaliana con el fin de realizar los respectivos ensayos de PCR y culminar con la secuenciación. Los resultados obtenidos verificaron la funcionalidad de los cebadores diseñados in silico, al permitir la amplificación de bandas de 1500 pb aproximadamente con el primer juego de cebadores y de 500 pb con el segundo juego de cebadores, ambas en la especie Epidendrum nocturnum. No se observaron productos de PCR en los géneros Restrepia, Gongora y en otras especies del Género Epidendrum. Se concluye que el gen AP2 podría ser considerado como marcador molecular, donde el diseño de cebadores es una tarea crucial que garantiza una adecuada identificación. |
Keywords: | BIOTECNOLOGÍA INVESTIGACIÓN CIENTÍFICA GENÉTICA MOLECULAR IDENTIFICACIÓN DE ESPECIES ORQUÍDEAS |
Issue Date: | Aug-2023 |
URI: | http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/25310 |
Language: | spa |
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