Análisis filogenéntico de quinua silvestre (Chenopodium quinoa Willd) utilizando el gen rpoB en muestras provenientes de las provincias de Carchi, Imbabura, Cotopaxi y Chimborazo

Abstract

La quinua silvestre (Chenopodium quinoa Willd.) es una de las especies de mayor importancia en el Ecuador por ser un recurso genético propio de nuestra serranía ecuatoriana. Las zonas de distribución de esta Amaranthacea abarca la gran mayoría de la región Andina de nuestro país, siendo las provincias de Carchi, Imbabura, Cotopaxi y Chimborazo las de mayor relevancia, por lo cual en el presente estudio se realiza el muestreo de 8 individuos por localidad siendo las zonas seleccionadas: El Hato (Carchi), Los Olivos (Imbabura), Belisario Quevedo (Cotopaxi) y Colta (Chimborazo), todas estas muestras fueron utilizados para la genotipificación de ADN, con la finalidad de establecer sus relaciones filogenéticas. La extracción y purificación del ADN se llevó a cabo mediante el protocolo propuesto por Doyle y Doyle (1987) modificado. La genotipificación de ADN se logró mediante la amplificación del fragmento del gen rpoB de 456 pb, posteriormente se secuenciaron los amplicones obtenidos en el equipo ABI PRISM 3730XL Analyzer de Macrogen. Los resultados del análisis genético permitieron la construcción de árboles filogenéticos los cuales revelaron que la diversificación genética es extremadamente alta de una manera interpoblacional e intrapoblacional obteniéndose un porcentaje de variabilidad de 77, 4 % para los individuos procedentes de las provincias de Carchi e Imbabura y de 70,2 % para los individuos procedentes de las provincias de Cotopaxi y Chimborazo, estos datos fueron aseverados con los valores obtenidos mediante las pruebas estadísticas de la AMOVA y la distancia génica; la significancia estadística de AMOVA dio a entender que la similitud entre los individuos de las provincias del norte (Carchi e Imbabura) es de solo 15 %, mientras que de las provincias del centro (Cotopaxi y Chimborazo) es de 25 %.