Análisis filogenético y biogeográfico del género Masdevallia (Orchidaceae) en Ecuador mediante el marcador molecular ITS

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Title: Análisis filogenético y biogeográfico del género Masdevallia (Orchidaceae) en Ecuador mediante el marcador molecular ITS
Authors: Cahuasquí Vallejo, Miguel Alejandro
Advisor: Ibarra Martínez, Marco Vinicio
Abstract: This study examines the phylogenetic relationships and biogeographic patterns of the genus Masdevallia in Ecuador, using the nuclear ITS marker in order to improve its taxonomic delimitation and provide criteria for the conservation of a highly diverse and morphologically complex lineage. The aim is to infer the phylogeny of Ecuadorian species and to evaluate their spatial structure based on molecular and geographic information. ITS sequences were compiled from public databases, considering those present in Ecuador. Quality control, alignment using MUSCLE, and evolutionary model selection were applied. Phylogenetic inferences were performed using RAxML and MrBayes, while biogeographic reconstruction was carried out with RASP using the BBM approach, integrating distribution records along the Ecuadorian Andean gradient. The results are expected to show higher interspecific resolution compared to plastid markers, as well as the identification of clades with congruent support for dispersal, vicariance, and altitudinal isolation. In addition, the recognition of key areas of diversification along the Andean axis is anticipated. These findings will contribute to prioritizing the conservation of endemic and threatened species, strengthening the evolutionary and biogeographic understanding of Orchidaceae in Ecuador.
Translated abstract: Este estudio examina las relaciones filogenéticas y patrones biogeográficos del género Masdevallia en Ecuador, utilizando el marcador nuclear ITS con el fin de mejorar su delimitación taxonómica y aportar criterios para la conservación de un linaje altamente diverso y morfológicamente complejo. Se busca inferir la filogenia de especies ecuatorianas y evaluar su estructura espacial a partir de información molecular y geográfica. Se compilaron secuencias ITS de bases públicas tomando en cuenta cuáles están presentes en Ecuador. Aplicamos control de calidad, alineamiento con MUSCLE y selección de modelos evolutivos. Las inferencias filogenéticas se realizaron con RAxML y MrBayes, mientras que la reconstrucción biogeográfica se efectuó con RASP mediante el enfoque BBM, integrando registros de distribución sobre el gradiente andino ecuatoriano. Los resultados anticipan una resolución interespecífica superior respecto a los marcadores plastídicos, la identificación de clados con soporte congruente de dispersión, vicariancia y aislamiento altitudinal. Además, se proyecta el reconocer áreas clave de diversificación a lo largo del eje andino. Los hallazgos contribuirán a priorizar la conservación de especies endémicas y amenazadas, fortaleciendo la comprensión evolutiva y biogeográfica de las Orchidaceae en Ecuador.
Keywords: BIOTECNOLOGÍA
TAXONOMÍA
GENÉTICA MOLECUALR
DISTRIBUCIÓN GEOGRÁFICA
Issue Date: 2026
URI: http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/32393
Language: spa
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