Estandarización de un protocolo de qPCR para la identificación de la enfermedad de la mancha blanca en camarones de piscina de las provincias del Guayas y Manabí

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Título : Estandarización de un protocolo de qPCR para la identificación de la enfermedad de la mancha blanca en camarones de piscina de las provincias del Guayas y Manabí
Autor : Zamora Corozo, Asly Jacksiny
Rosero Tamayo, Greisy Camila
Director de Tesis: Cerna Cevallos, Marco Fernando
Resumen traducido: The present thesis work had the purpose of carrying out the standardization of a qPCR protocol for the identification of white spot disease in shrimp farms in the provinces of Guayas and Manabi. Positive samples of shrimp exhibiting characteristic signs and symptoms of the disease of interest were used, along with samples taken directly from the pools of the mentioned provinces. The procedures that were carried out were the extraction of the DNA of each sample by different methods; DNA quantification by Qubit and NanoDrop; evaluation of DNA integrity by agarose gel electrophoresis; evaluation and selection of primers; qPCR amplification and protocol evaluation. The results obtained indicate that it was possible to adequately standardize the protocol for the identification of the white spot disease, which was evaluated with a dilution test to know the sensitivity of the protocol in the analysis of this disease presented by pool shrimp. Therefore, it is concluded that White spot detection is possible using a qPCR protocol.
Resumen : El presente trabajo de titulación tuvo el propósito de realizar la estandarización de un protocolo de qPCR para la identificación de la enfermedad de la mancha blanca en camarones de piscina de las provincias del Guayas y Manabí, se emplearon muestras positivas de camarón que presentaban signos y síntomas característicos de la enfermedad de interés, a su vez se tomaron muestras directamente de las piscinas de las provincias mencionadas. Los procedimientos que se realizaron fueron la extracción del ADN de cada individuo por diferentes métodos; la cuantificación de ADN por Qubit y NanoDrop; la evaluación de la integridad del ADN mediante electroforesis en gel de agarosa; evaluación y selección de primers; la amplificación por qPCR y la evaluación del protocolo. Los resultados obtenidos indican que, se logró estandarizar adecuadamente el protocolo para la identificación de la enfermedad de la mancha blanca, el cual se evaluó con una prueba de diluciones para conocer la sensibilidad del protocolo en el análisis de esta enfermedad que presentan los camarones de piscinas. Por lo tanto, se concluye que es posible la detección de mancha blanca haciendo uso de un protocolo de qPCR
Palabras clave : BIOTECNOLOGÍA
ADN
MANCHA BLANCA -- CAMARÓN
QPCR
Fecha de publicación : 2023
URI : http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/25542
Idioma: spa
Pertenece a las colecciones: Grado

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