Revisión de las especies latinoamericanas de orquídeas del género Dracula mediante la técnica molecular barcode

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Título : Revisión de las especies latinoamericanas de orquídeas del género Dracula mediante la técnica molecular barcode
Autor : Montalvo Pazmiño, Miguel Ángel
Vargas García, Luciana Moncerat
Director de Tesis: Cerna Cevallos, Marco Fernando
Resumen traducido: The genus Dracula, belongs to the family Orchidaceae, the morphology of his flowers has made it easily distinguishable from another genus of Neotropical orchids and is one of the species mostly pollinated by Diptera. Around 130 species of Dracula have been described, distributed from southeastern Mexico to northern Peru. For the study, 176 individuals of Dracula were collected in orchid orchards of the provinces of Azuay and Pichincha. DNA was extracted by the modified Doyle & Doyle method, by means of the conventional PCR technique the segments of the matK region and the ITS intergenic spacer were amplified with the use of the Phire Plant Direct PCR Master Mix kit, the products were sequenced using the Sanger method and studied with Boldsystems and Blast bioinformatics tools to verify the identity of the species, two trees were made one per region with the Maximum Likelihood technique and the Tamura-Nei model of the Mega 7 software. The obtained phylogenetic results indicate that the matK region presented a greater interspecies variability, while the ITS region proved not to be discriminative to differentiate the subgeneric classification of the genus Dracula, besides it allowed to propose a change in the classification of the classical systematics given by Luer (1993), the biogeographical analysis proposes that Carchi in Ecuador and the Putumayo Eastern Cordillera in Colombia, are the areas with the highest density of the genus.
Resumen : El género Dracula, pertenece a la familia Orchidaceae, la morfología de sus flores han hecho que se distinga fácilmente de otros géneros de orquídeas neotropicales y sean especies mayoritariamente polinizadas por dípteros. Se reconocen alrededor de 130 especies de Dracula, distribuidas desde el sureste de México hasta el Norte de Perú. Para el estudio se recolectaron 176 individuos de Dracula en orquidearios de las provincias de Azuay y Pichincha, se extrajo ADN mediante el método Doyle & Doyle modificado, mediante la técnica PCR convencional se amplificaron los segmetos de la región matK y el espaciador intergénico ITS con el uso del kit Phire Plant Direct PCR Master Mix, los productos fueron secuenciados mediante el método Sanger y estudiados con las herramientas bioinformáticas Boldsystems y Blast para verificar la identidad de las especies, se realizaron dos árboles uno por cada región con la técnica Maximum Likelihood y modelo Tamura-Nei del software Mega 7. Los resultados filogenéticos obtenidos señalan que la región matK presentó una mayor variabilidad interespecie, mientras que la región ITS demostró no ser discriminativa para diferenciar la clasificación subgenérica del género Dracula, además permitió proponer un cambio en la clasificación de la sistemática clásica dada por Luer (1993), el anañisis biogeográfico propone que Carchi en Ecuador y la cordillera Oriental Putumayo en Colombia, son las zonas con mayor densidad del género.
Palabras clave : BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALEZA
ORCHIDACEAE
DRACULA
MATK
Fecha de publicación : mar-2019
URI : http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16978
Idioma: spa
Pertenece a las colecciones: Grado

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