Uso de herramientas bioinformáticas para el análisis filogenético de las especies de la subfamilia triatominae vectores de la enfermedad de chagas

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Title: Uso de herramientas bioinformáticas para el análisis filogenético de las especies de la subfamilia triatominae vectores de la enfermedad de chagas
Authors: Valencia Henríquez, Dominic Carolina
Zambrano Moya, Marco Antonio
Advisor: Karolys Gutiérrez, Germania Margarita
Abstract: Chagas disease is one of the most damaging parasitic infections in Latin America that is still ignored. The knowledge about the phylogeny of its vector insects, the Triatominae (Hemiptera: Reduviidae), is very scarce. The main objective of this study is to provide, for the first time, a phylogenetic analysis of the triatomines that includes the 154 existing species, using the combination of molecular and morphological markers for the construction of the phylogeny.To obtain the combined phylogenetic tree (molecular and morphological markers), 14 molecular markers were taken from the GenBank nucleotide database (NCBI), which were analyzed and aligned using the Geneious application of the Geneious R11 platform. Subsequently, the matrix with the concatenated sequences was built with the use of the SequenceMatrix Version 1.8 program. Mining of data from bibliographic sources was also performed, in which 63 key characters were obtained, useful as morphological markers, which were coded in MorphoBank to obtain the matrix. Finally, both matrices were combined manually and the combined maximum likelihood phylogenetic analysis was carried out with the help of the IQ-TREE program v1.6.9. The phylogenetic analysis carried out with bioinformatic tools demonstrates that morphological and molecular phylogenies generate remarkably similar trees that validate each other. The combined tree demonstrates the monophyly of the subfamily and paraphilia in genera within the Rhodniini (Rhodnius and Psammolestes) and Triatomini (Triatoma and Panstrogylus) tribes. Likewise, 5 tribes are clearly evident: Alberproseniini, Bolboderini, Cavernicolini, Rhodniini and Triatomini.
Translated abstract: La enfermedad de Chagas es una de las infecciones parasitarias más perjudiciales de Latinoamérica que aún se encuentra desentendida. El conocimiento sobre la filogenia de sus insectos vectores, los Triatominae (Hemíptera: Reduviidae), es muy escaso. El objetivo principal de este estudio es proporcionar, por primera vez, un análisis filogenético de los triatominos que incluya las 154 especies existentes, usando la combinación de marcadores moleculares y morfológicos para la construcción de la filogenia. Para obtener el árbol filogenético combinado (marcadores moleculares y morfológicos), se tomaron 14 marcadores moleculares de la base de datos de nucleótidos del GenBank (NCBI), los mismos que fueron analizados y alineados usando la aplicación Geneious de la plataforma Geneious R11. Posteriormente se construyó la matriz con las secuencias concatenadas con el uso del programa SequenceMatrix Versión 1.8. También se realizó una minería de datos de fuentes bibliográficas en el que se obtuvieron 63 caracteres clave útiles como marcadores morfológicos, los mismos que fueron codificados en MorphoBank para obtener la matriz. Finalmente se combinaron manualmente ambas matrices y se realizó el análisis filogenético combinado de máxima verosimilitud con ayuda del programa IQ-TREE v1.6.9. El análisis filogenético realizado con herramientas bioinformáticas demuestra que las filogenias morfológicas y moleculares generan árboles notablemente similares y que se validan entre sí. El árbol combinado demuestra la monofília de la subfamilia y la parafilia en géneros dentro de las tribus Rhodniini (Rhodnius y Psammolestes) y Triatomini (Triatoma y Panstrogylus). Así mismo se evidencia claramente 5 tribus: Alberproseniini, Bolboderini, Cavernicolini, Rhodniini y Triatomini.
Keywords: BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALEZA
TRIOTOMINAE
ENFERMEDAD DE CHAGAS
FILOGENIA
Issue Date: Mar-2019
URI: https://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16977
Language: spa
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