Identificación molecular del género Passiflora (Passifloraceae), de la región norte del ecuador por medio del método DNA Barcoding

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Title: Identificación molecular del género Passiflora (Passifloraceae), de la región norte del ecuador por medio del método DNA Barcoding
Authors: Miño Domínguez, Jorge Eduardo
Advisor: Cerna Cevallos, Marco Fernando
Abstract: El nombre del género Passiflora quiere decir flor de la pasión, por otro lado este género tiene un alto interés económico debido al uso medicinal, alimenticio y ornamental de sus flores y frutos, en el Ecuador se tiene registros de 95 especies de este género, en esta investigación se colectaron al azar muestras de especies de este grupo presentes en la región norte del Ecuador en las provincias de: Pichincha, Santo Domingo, Napo, Tungurahua, Cotopaxi; en pisos altitudinales que van desde los 400 hasta los 2800 m.s.n.m, las muestras fueron identificadas a nivel de especie mediante comparación con vouchers del Herbario Nacional del Ecuador QCNE, para la identificación molecular se extrajo el ADN mediante el método de Doyle y Doyle, seguidamente se amplificó un segmento del gen matK mediante la técnica PCR convencional, los productos PCR fueron secuenciados mediante la técnica Sanger, las secuencias fueron analizadas con las herramientas Blast y Boldsystem para identificar a que especie corresponden, siendo Blast la mejor herramienta para identificación. A continuación se realizó un análisis filogenético utilizando los segmentos del gen matK y la información del segmento rcbL que está disponible en Genbank, se elaboraron 3 árboles uno por cada segmento y uno concatendando los árboles construidos por el segmento matk y el concatenado muestran similitud en la agrupación de especies en concordancia con la morfología, mientras que el segmento rbcL arrojó una diferencias en la distribución.
Translated abstract: The name of the genus Passiflora means flower of passion, on the other hand this genus has a high economic interest due to medicinal, nutritional and ornamental use of its flowers and fruits, in Ecuador there are records of 95 species of this genus, in this research samples of species of this group present in the northern region of Ecuador were collected at random in the provinces of: Pichincha, Santo Domingo, Napo , Tungurahua, Cotopaxi; in altitudinal floors ranging from 400 to 2800 meters above sea level, the samples were identified at the species level by comparison with vouchers of the National Herbarium of Ecuador QCNE, for the molecular identification the DNA was extracted by the Doyle y Doyle method, then amplified a segment of the matK gene by means of the conventional PCR technique, PCR products were sequenced using the Sanger technique, the sequences were analyzed with the Blast and Boldsystem tools to identify which species they correspond to, Blast being the best tool for identification. Next, a phylogenetic analysis was performed using the segments of the matK gene and the rcbL segment information that is available in Genbank, 3 trees were elaborated one for each segment and one concatenating the trees constructed by the matk segment and the concatenated one show similarity in the grouping of species in accordance with the morphology, while the segment rbcL showed a difference in the distribution.
Keywords: BIOTECNOLOGÍA
PASSIFLORA
ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO -- BARDCODING
Issue Date: Sep-2018
URI: http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16148
Language: spa
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