Identificación molecular de las especies del género Brugmansia (Solanaceae), presentes en la zona norte de los Andes del Ecuador

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Title: Identificación molecular de las especies del género Brugmansia (Solanaceae), presentes en la zona norte de los Andes del Ecuador
Authors: Escobar Mena, Edison David
Advisor: Cerna Cevallos, Marco Fernando
Abstract: Las especies del género Brugmansia poseen sustancias tóxicas alcaloideas que se usan para elaborar sustancias psicotrópicas. Su ingestión en humanos y animales resulta fatal en dosis excesivas. En el Ecuador se conocen 7 especies, de las cuales 5 se han registrado en la zona andina, las especies son: Brugmansia arborea, B. aurea, B. x candida, B. suaveolens, B. insignis, B. versicolor, B. sanguinea y B. vulcanicola. Se recolectó muestras en varias provincias del Ecuador: Carchi, Pichincha, Cotopaxi, Napo y Morona Santiago. Obteniéndose 40 muestras de diferentes especímenes del género, a las cuales se les extrajo ADN por el método Doyle & Doyle modificado, posteriormente se amplificó segmentos de las regiones matK, rpoB y rpoC1, mediante la técnica PCR convencional, luego los productos fueron secuenciados a través de la técnica Sanger y analizados con las herramientas bioinformáticas: Boldsystems y Blast para verificar la identidad de las especies. Se elaboraron 4 árboles filogenéticos, 1 por cada región y 1 árbol concatenando las 3 regiones, para esto se utilizó el método Neighbor Joining Tree del software Mega 7; la región matK permitió elaborar un árbol que evidencia la agrupación de especies, esto en concordancia con la distribución geográfica de las mismas. La región rpoB mostró menor diferencia de grupos demostrando poca variabilidad del gen. Adicionalmente se estudió la distribución geográfica del género Brugmansia en Ecuador, determinando que el punto de diversificación de las especies se localiza en la zona nor-oriental de los Andes.
Translated abstract: The Brugmansia species possess toxic alkaloid substances that are used to make psychotropic substances. Its ingestion in humans and animals is fatal in excessive doses. In Ecuador 7 species are known, of which 5 have been registered in the Andean zone, the species are: Brugmansia arborea, B. aurea, B. x candida, B. suaveolens, B. insignis, B. versicolor, B. sanguinea and B. vulcanicola. Samples were collected in several provinces of Ecuador: Carchi, Pichincha, Cotopaxi, Napo and Morona Santiago. Obtaining 40 samples of different specimens of the genus, to which DNA was extracted by the modified Doyle & Doyle method, later amplified segments of the matK, rpoB and rpoC1 regions, by means of the conventional PCR technique, then the products were sequenced through of the Sanger technique and analyzed with the bionformatic tools: Boldsystems and Blast to verify the identity of the species. 4 phylogenetic trees were developed, 1 for each region and 1 tree concatenated the 3 regions, for this the Neighbor Joining Tree method of Mega 7 software was used; the matK region allowed the elaboration of a tree that shows the grouping of species, this in accordance with the geographical distribution of the same. The rpoB region showed less difference of groups demonstrating little variability of the gene. Additionally, the geographical distribution of the Brugmansia genus in Ecuador was studied, determining that the diversification point of the species is located in the north-eastern zone of the Andes.
Keywords: BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES
BRUGMANSIA
ADN
SOLANACEAE
Issue Date: Apr-2018
URI: http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/15451
Language: spa
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