Identificación molecular del complejo Burkholderia cepacia, bacteria productora de antibióticos, mediante PCR en tiempo real.

Abstract

La presente investigación tuvo como objetivo principal identificar molecularmente bacterias productoras de antibióticos del Complejo Burkholderia cepacia; identificadas bioquímicamente como Burkholderia cepacia por Egas y Tinajero (2016), con un porcentaje de probabilidad 88,79% y 99,51% para BC1 y BC2 respectivamente. Para alcanzar el objetivo, se analizaron estadísticamente los métodos de extracción y purificación de ADN: Kit-Roche, Ebullición y PCI, la prueba ANOVA y Tukey determinó una diferencia significativa (p˂0,001) entre los métodos implementados, la metodología Kit-Roche presentó los mejores resultados de calidad y concentración 8,80E+03 y 3,61E+03 (ng/mL) de ADN para BC1 y BC2; sin embargo el método por Ebullición se muestra como una alternativa de bajo costo al presentar pureza y una concentración de 2,40E+03 y 2,41E+03 (ng/mL) de ADN para BC1 y BC2, características de calidad aceptables para la técnica PCR en tiempo real. Para la identificación molecular, se amplificaron las regiones 16S rARN-CBc, Burkholderia sp. (recA) y B. cepacia-genomovar I (recA) empleando primers específicos, el análisis de las curvas de amplificación obtenidas mediante PCR en tiempo real confirmaron que BC1 pertenece a la especie Burkholderia cepacia (genomovar I), especie que conforma el Complejo Burkholderia cepacia; a su vez, se confirmó que BC2 pertenece al: género Burkholderia, pero no se corroboró el genomovar del organismo; sin embargo se asevera que la cepa pertenece algún genomovar del CBc basándonos en la amplificación de la región 16S para CBc y su identificación bioquímica.