Comparación de la variabilidad genética de tres regiones de ADN cloroplástico y una nuclear en el Ishpingo (O. quixos) proveniente de 5 provincias de la Amazonía ecuatoriana

Abstract

Ocotea quixos (Lam.) Kosterm. (Ishpingo) es un árbol que crece en bosques húmedos tropicales de Sudamérica (310 - 1200 msnm) y se utiliza como medicina y condimento, ya que posee aceites esenciales con propiedades antiplaquetarias, antitrombóticas, entre otras. En Ecuador, las poblaciones silvestres de Ishpingo, son reducidas por la transformación de ecosistemas, deforestación y cultivo clonal. Este estudio comparó la variabilidad genética de tres regiones de ADN cloroplástico (matK, rbcLa y psbA trnH) y una nuclear ITS de Ishpingo proveniente de 5 provincias de la Amazonía ecuatoriana. En base a los alineamientos obtenidos se realizó la filogenia utilizando el criterio de máxima verosimilitud, con un bootstrap de 1000 réplicas y con Jukes Cantor. La variabilidad genética se determinó mediante el coeficiente de conservación de ADN y el coeficiente de variabilidad nucleotídica de Nei (π). La variabilidad nucleotídica de las regiones matK, rbcLa y psbA-trnH fueron bajas (π ≤ 0.005), debido a su alto grado de conservación. La región ITS presentó una variabilidad superior (π= 0.11), agrupando a los individuos analizados en dos clados. Los resultados de la región ITS pueden estar afectados por la homoplasia que presenta esta región. Las regiones analizadas no fueron útiles para el estudio de variabilidad genética en Ishpingo. Por lo que se sugiere analizar nuevas regiones de ADN cloroplástico y nuclear, que permitan realizar estudios de genética poblacional de esta especie en el Ecuador.