Evaluación y comparación de técnicas bioinformáticas para el análisis de expresión diferencial en NGS
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http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/25690| Título : | Evaluación y comparación de técnicas bioinformáticas para el análisis de expresión diferencial en NGS |
| Autor : | Jara Moscoso, Jacqueline Michelle Saquipay Nieves, Kerly Samantha |
| Director de Tesis: | Malo Cevallos, Inés Patricia |
| Resumen traducido: | Based on simulations with RNA-Seq data, DGE analyses were performed with Bioconductor packages (DESeq2, EdgeR and Limma) to determine optimal parameters in relation to the number of samples (n), total transcripts (m) and DE genes (diffexp). To subsequently perform DGE analysis with a real dataset obtained from GEO. |
| Resumen : | Mediante simulaciones con datos de RNA-Seq se realizaron análisis DGE con paquetes de Bioconductor (DESeq2, EdgeR y Limma) para determinar parámetros óptimos en relación al número de muestras (n), transcritos totales (m) y genes DE (diffexp). Para posteriormente llevar a cabo análisis DGE con un conjunto de datos reales obtenidos de GEO. |
| Palabras clave : | BIOTECNOLOGÍA SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS BIOINFORMÁTICA ARN EXPRESIÓN DEL GEN |
| Fecha de publicación : | ago-2023 |
| URI : | http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/25690 |
| Idioma: | spa |
| Pertenece a las colecciones: | Grado |
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