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Title: Análisis filogenéntico de quinua silvestre (Chenopodium quinoa Willd) utilizando el gen rpoB en muestras provenientes de las provincias de Carchi, Imbabura, Cotopaxi y Chimborazo
Authors: Navarrete Verdesoto, Stephany Johanna
Suasnavas Chacón, Byron Alejandro
Advisor: Guevara Granja , María Fernanda
Keywords: BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES
CHENOPODIUM QUINOA
QUINUA
DIVERSIDAD GENÉTICA
Issue Date: May-2015
Abstract: La quinua silvestre (Chenopodium quinoa Willd.) es una de las especies de mayor importancia en el Ecuador por ser un recurso genético propio de nuestra serranía ecuatoriana. Las zonas de distribución de esta Amaranthacea abarca la gran mayoría de la región Andina de nuestro país, siendo las provincias de Carchi, Imbabura, Cotopaxi y Chimborazo las de mayor relevancia, por lo cual en el presente estudio se realiza el muestreo de 8 individuos por localidad siendo las zonas seleccionadas: El Hato (Carchi), Los Olivos (Imbabura), Belisario Quevedo (Cotopaxi) y Colta (Chimborazo), todas estas muestras fueron utilizados para la genotipificación de ADN, con la finalidad de establecer sus relaciones filogenéticas. La extracción y purificación del ADN se llevó a cabo mediante el protocolo propuesto por Doyle y Doyle (1987) modificado. La genotipificación de ADN se logró mediante la amplificación del fragmento del gen rpoB de 456 pb, posteriormente se secuenciaron los amplicones obtenidos en el equipo ABI PRISM 3730XL Analyzer de Macrogen. Los resultados del análisis genético permitieron la construcción de árboles filogenéticos los cuales revelaron que la diversificación genética es extremadamente alta de una manera interpoblacional e intrapoblacional obteniéndose un porcentaje de variabilidad de 77, 4 % para los individuos procedentes de las provincias de Carchi e Imbabura y de 70,2 % para los individuos procedentes de las provincias de Cotopaxi y Chimborazo, estos datos fueron aseverados con los valores obtenidos mediante las pruebas estadísticas de la AMOVA y la distancia génica; la significancia estadística de AMOVA dio a entender que la similitud entre los individuos de las provincias del norte (Carchi e Imbabura) es de solo 15 %, mientras que de las provincias del centro (Cotopaxi y Chimborazo) es de 25 %.
Description: The willd quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) is one of the most important species in Ecuador for being a resource of our own genetic Ecuadorian highlands. The distribution areas of this Amaranthacea covers the vast majority of the Andean region of our country, being the provinces of Carchi, Imbabura, Cotopaxi and Chimborazo the most important, therefore in this study the sampling of 8 individuals is by locality being targeted areas: El Hato (Carchi), Los Olivos (Imbabura), Belisario Quevedo (Cotopaxi) and Colta (Chimborazo), all of these samples were used for DNA genotyping, in order to establish their phylogenetic relationships The extraction and purification of DNA was performed by the method proposed by Doyle and Doyle (1987) modified protocol. Genotyping was accomplished by DNA amplification of the rpoB gene fragment of 456 bp amplicons obtained later in the ABI PRISM 3730XL equipment Macrogen Analyzer sequenced. The results of genetic analysis allowed the construction of phylogenetic trees which revealed that genetic diversity is extremely high for a population-way inter and intra-population variability obtaining a percentage of 77, 4% for individuals from the provinces of Carchi and Imbabura and 70.2% for individuals from the provinces of Cotopaxi and Chimborazo, these data were corroborated with the values obtained by statistical tests of the AMOVA and genetic distance; the statistical significance of AMOVA hinted that the similarity between individuals of the northern provinces (Carchi and Imbabura) is only 15%, whereas in the central provinces (Cotopaxi and Chimborazo) is 25%.
URI: http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/9408
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