Please use this identifier to cite or link to this item: http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/14196
Title: Comparación de la variabilidad genética de tres regiones de ADN cloroplástico y una nuclear en el Ishpingo (O. quixos) proveniente de 5 provincias de la Amazonía ecuatoriana
Authors: Rivas Navarrete, Patricio Israel
Salazar Costa, Paula Elizabeth
Advisor: Karolys Gutiérrez, Germania Margarita
Keywords: BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES
OCOTEA QUIXOS
KOSTERM
GENÉTICA VEGETAL
Issue Date: May-2017
Abstract: Ocotea quixos (Lam.) Kosterm. (Ishpingo) es un árbol que crece en bosques húmedos tropicales de Sudamérica (310 - 1200 msnm) y se utiliza como medicina y condimento, ya que posee aceites esenciales con propiedades antiplaquetarias, antitrombóticas, entre otras. En Ecuador, las poblaciones silvestres de Ishpingo, son reducidas por la transformación de ecosistemas, deforestación y cultivo clonal. Este estudio comparó la variabilidad genética de tres regiones de ADN cloroplástico (matK, rbcLa y psbA trnH) y una nuclear ITS de Ishpingo proveniente de 5 provincias de la Amazonía ecuatoriana. En base a los alineamientos obtenidos se realizó la filogenia utilizando el criterio de máxima verosimilitud, con un bootstrap de 1000 réplicas y con Jukes Cantor. La variabilidad genética se determinó mediante el coeficiente de conservación de ADN y el coeficiente de variabilidad nucleotídica de Nei (π). La variabilidad nucleotídica de las regiones matK, rbcLa y psbA-trnH fueron bajas (π ≤ 0.005), debido a su alto grado de conservación. La región ITS presentó una variabilidad superior (π= 0.11), agrupando a los individuos analizados en dos clados. Los resultados de la región ITS pueden estar afectados por la homoplasia que presenta esta región. Las regiones analizadas no fueron útiles para el estudio de variabilidad genética en Ishpingo. Por lo que se sugiere analizar nuevas regiones de ADN cloroplástico y nuclear, que permitan realizar estudios de genética poblacional de esta especie en el Ecuador.
Description: Ocotea quixos (Lam.) Kosterm. (Ishpingo) is a tree that grows in humid tropical forests of South America (310-1200 msnm). It is used for food and medicine since it possesses essential oils with antiplatelet, antithrombotic properties, among others. In Ecuador, the wild populations of Ishpingo has been reduced by ecosystem transformation, deforestation and clonal cultivation. This study compared the genetic variability of three regions of chloroplastic DNA (matK, rbcLa and psbA-trnH) and one nuclear region (ITS) in Ishpingo from 5 provinces of the Ecuadorian Amazon. Based on the obtained alignments, the phylogeny was performed using the maximum likelihood criterion, with a bootstrap of 1000 replicates and with Jukes-Cantor. The genetic variability was determined using the DNA conservation coefficient and the Nei (π) nucleotide variability coefficient. The nucleotide variability of matK, rbcLa and psbA-trnH regions was low (π ≤ 0.005) due to their high degree of conservation. The ITS region presented a superior variability (π = 0.11), grouping the individuals analyzed in two clades. The results of the ITS region may be affected due to the homoplasy that it possesses. The regions analyzed were not useful for the study of genetic variability in Ishpingo. Therefore, it is suggested that new chloroplastic and nuclear DNA regions be analyzed, that allow studies of population genetics of this species in Ecuador to be carried out.
URI: http://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/14196
Appears in Collections:Ingeniería en Biotecnología de los Recursos Naturales GIRON - Tesis de Pregrado

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
UPS-QT11665.pdfTexto completo 2.16 MBAdobe PDFView/Open


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons